2006 KPSS sınavı ÖSYM tarafından 17 eylül'de yapıldı. Sınav öncesinde alınan başvurular sırasında adaylar, liselerin hangi alanlarından mezun olduklarını kendi beyanları ile belirledi.
Ancak bu belirleme sırasında bazı imam hatip lisesi mezunları alanlarını "Edebiyat" veya "Sosyal Bilimler ve Edebiyat" olarak belirlemiştir. Bu belirlemeden dolayı da, imam hatip lisesi mezunu oma şartını arayan kadroları tercih eden bu durumdaki adayların tercihleri işleme konulmamıştır. Zira, ÖSYM bilgisayarları bu adayları imam hatip lisesi mezunu olarak görmemiştir. Kendisinden daha düşük puanlı adayların yerleştiğini iddia eden imam hatip lisesi mezunlarının tümünde bu sorun tespit edilmiştir.
Bu durumdaki adayların, ÖSYM'ye, sınav kılavuz ekindeki genel amaçlı dilekçe
örneği ile başvurarak veya imkanı varsa Ankara Bilkent'teki ÖSYM bürosuna giderek,
alanlarını imam hatip lisesi şeklinde değiştirmesi gerekmektedir.