MarmaraÜniversitesi'ndeki yapılanmaya dair iddianamede yer alan tespitler:
Üniversiteler bilim yuvası değil FETÖ'ye eleman kazandıran hücre evi gibi kullanıldı.
Örgüt, sınav sorularını binlerce adaya sızdırarak kendi akademik kadrosunu oluşturdu.
FETÖ taşra üniversitelerinde etkin bir konumdaydı. Buralardaki akademisyenlerin büyük üniversitelere geçişi sağlandı.
Rektörlük seçimlerinde örgüt üyesi veya örgüte yakın rektör adayı desteklendi ve her türlü yolla seçilmesi sağlandı.
Üniversite bütçeleri örgüt çıkarları için kullanıldı.
FETÖ'cü akademisyenler, örgütün amaçlarına hizmet eden birer militan gibi hareket etti.